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安捷倫 熒光定量PCR技術(shù)應用簡(jiǎn)介
點(diǎn)擊次數:900 更新時(shí)間:2019-12-20
     一、安捷倫 熒光定量PCR原理
 
    1、熒光共振能量傳遞 (FRET)
 
    某熒光標記基團在激發(fā)光刺激下生成某波長(cháng)的發(fā)射光,當另一屏蔽基團與其距離合適時(shí),原發(fā)射光將會(huì )被屏蔽基團所吸收,并轉化為其他波長(cháng)的發(fā)射光或熱能,稱(chēng)之為FRET。
 
    2、熒光化學(xué):
 
    安捷倫 熒光定量PCR所使用的熒光化學(xué)可分為兩種:熒光探針和熒光染料。PCR擴增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個(gè)報告熒光基團和一個(gè)淬滅熒光基團。探針完整時(shí),報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步。
 
    二、安捷倫 熒光定量PCR技術(shù)靶基因的確定及引物和探針的設計原則
 
    1、靶基因的確定:選擇檢測組共有的基因以避免檢測的假陰性(漏檢)。
 
    2、檢測片段的確定:選擇檢測組內的保守 (突變少)(避免假陰性)、組間特異的序列 (突變多)(避免假陽(yáng)性)作為引物探針的設計位置。片段長(cháng)度70-150bp。
 
    3、引物:長(cháng)度17-25bp;GC含量30-80%;退火溫度(Tm值)58-60℃;避免穩定的引物二聚體(特別是多聯(lián)檢測)及發(fā)夾結構(自由能大于-3.5kc/m);序列不能出現連續的G,3’端避免G或C,后5個(gè)堿基內避免兩個(gè)以上的G或C。
 
    4、探針:長(cháng)度20-30bp(Taqman)或16-25bp(MGB);GC含量30-80%;Tm值為68-70℃;避免穩定的二聚體及發(fā)夾結構 (自由能大于-3.5kc/m);5’端不能是G;位置盡量靠近上游引物;選擇波長(cháng)差異較大(多聯(lián)檢測)或Fam(單聯(lián)檢測)的熒光標記。
 
    三、安捷倫 熒光定量PCR特點(diǎn)和優(yōu)勢
 
    1、特異性強:引物和探針的“雙保險”,避免檢測的假陽(yáng)性。
 
    2、靈敏度高:分析PCR產(chǎn)物的對數期,自動(dòng)化儀器收集熒光信號,避免了許多人為因素干擾。
 
    3、避免污染:全封閉反應,無(wú)須PCR后處理。
 
    4、實(shí)現定量:運用標準品獲得標準曲線(xiàn),結合Ct值進(jìn)行準確定量。
 
    5、高效低耗:可實(shí)現一管多檢。
 
    6、操作簡(jiǎn)便:在線(xiàn)式實(shí)時(shí)監測擴增結果,不必接觸有害物質(zhì)。
 
    7、快速:反應時(shí)間<1.5小時(shí)。
 
    四、安捷倫 熒光定量PCR實(shí)用意義:
 
    1、提高檢測效率,縮短檢測周期,提高通關(guān)速度;
 
    2、降低檢測成本,提高經(jīng)濟與社會(huì )效益。