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1 核酸定量分析： 對傳染性疾病進(jìn)行定量定性分析，病原微生物或病毒含量的檢測 , 比如近期流行的甲型H1N1流感， 轉基因動(dòng)植物基因拷貝數的檢測，RNAi 基因失活率的檢測等。 

 

2 基因表達差異分析：比較經(jīng)過(guò)不同處理樣本之間特定基因的表達差異 ( 如藥物處理、物理處理、化學(xué)處理等 ) ，特定基因在不同時(shí)相的表達差異以及cDNA芯片或差顯結果的確證。

 

3 SNP 檢測：檢測單核苷酸多態(tài)性對于研究個(gè)體對不同疾病的易感性或者個(gè)體對特定藥物的不同反應有著(zhù)重要的意義，因分子信標結構的巧妙性，一旦SNP 的序列信息是已知的，采用這種技術(shù)進(jìn)行高通量的 SNP 檢測將會(huì )變得簡(jiǎn)單而準確。 

 

4 甲基化檢測：甲基化同人類(lèi)的許多疾病有關(guān)，特別是癌癥， Laird 報道了一種稱(chēng)作 Methylight的技術(shù)，在擴增之前先處理 DNA ，使得未甲基化的胞嘧啶變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不受影響，用特異性的引物和 Taqman探針來(lái)區分甲基化和非甲基化的 DNA ，這種方法不僅方便而且靈敏度更高。